Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mkrn3Q60764 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mkrn3Q60764 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms