Protein–RNA interactions for Protein: Q60738

Slc30a1, Zinc transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a1Q60738 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc30a1Q60738 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc30a1Q60738 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms