Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb6Q60692 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms