Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF38BQ5VTL8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF38BQ5VTL8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms