Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psme4Q5SSW2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psme4Q5SSW2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms