Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim58Q5NCC9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim58Q5NCC9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.4 ms