Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Carmil2Q3V3V9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.8 ms