Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930567H17RikQ3V0K5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930567H17RikQ3V0K5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms