Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C87499Q3UX49 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C87499Q3UX49 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms