Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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