Protein–RNA interactions for Protein: Q3U095

Nxpe2, NXPE family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe2Q3U095 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nxpe2Q3U095 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe2Q3U095 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nxpe2Q3U095 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms