Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrx1Q3TL44 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrx1Q3TL44 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms