Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT24Q2M2I5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT24Q2M2I5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 674.1 ms