Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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ptchd1Q14B62 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ptchd1Q14B62 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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ptchd1Q14B62 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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ptchd1Q14B62 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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ptchd1Q14B62 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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