Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTCH1Q13635 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
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