Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-7■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 LMNB2-205ENST00000532465 769 ntTSL 319.76■□□□□ 0.751e-7■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 SLC9A3R1-205ENST00000583369 841 ntTSL 324.55■■□□□ 1.522e-16■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.872e-16■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.592e-16■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 SLC9A3R1-203ENST00000578958 714 ntTSL 218.73■□□□□ 0.592e-16■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 SLC9A3R1-204ENST00000581356 519 ntTSL 313.39□□□□□ -0.272e-16■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 HSP90B1-202ENST00000540297 590 ntTSL 320.78■□□□□ 0.921e-38■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.28■□□□□ 0.681e-38■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61e-38■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 HSP90B1-204ENST00000548622 839 ntTSL 218.63■□□□□ 0.571e-38■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 HSP90B1-205ENST00000549334 581 ntTSL 418.39■□□□□ 0.531e-38■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.511e-38■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.011e-38■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 211.51□□□□□ -0.571e-38■□□□□ 8.2
GRSF1Q12849 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.445e-17■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.035e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.875e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 AHCTF1-205ENST00000478568 611 ntTSL 417.66■□□□□ 0.425e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.345e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.195e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.115e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.065e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.045e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.075e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME2-208ENST00000570801 565 ntTSL 213.7□□□□□ -0.225e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.385e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 CCND1-201ENST00000227507 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.65e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NME2-209ENST00000573262 789 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.745e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 MTHFD2-206ENST00000477455 696 ntTSL 37.69□□□□□ -1.183e-7■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.888e-10■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 MRPL51-204ENST00000540949 343 ntTSL 218.3■□□□□ 0.528e-10■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 LMNB2-202ENST00000475819 885 ntTSL 517.71■□□□□ 0.438e-10■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.048e-10■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.278e-10■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.278e-10■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.758e-10■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.756e-60■□□□□ 8.1
GRSF1Q12849 NEK9-203ENST00000553945 786 ntTSL 524.31■■□□□ 1.483e-7■□□□□ 8
GRSF1Q12849 NEK9-204ENST00000554258 578 ntTSL 318.58■□□□□ 0.563e-7■□□□□ 8
GRSF1Q12849 NEK9-211ENST00000557673 657 ntTSL 317.81■□□□□ 0.443e-7■□□□□ 8
GRSF1Q12849 NEK9-209ENST00000556170 3975 ntTSL 514.04□□□□□ -0.163e-7■□□□□ 8
GRSF1Q12849 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-7■□□□□ 8
GRSF1Q12849 NEK9-202ENST00000553823 577 ntTSL 511.83□□□□□ -0.523e-7■□□□□ 8
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