Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MestQ07646 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MestQ07646 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MestQ07646 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MestQ07646 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MestQ07646 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MestQ07646 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MestQ07646 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MestQ07646 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MestQ07646 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MestQ07646 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MestQ07646 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MestQ07646 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MestQ07646 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MestQ07646 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MestQ07646 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MestQ07646 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MestQ07646 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MestQ07646 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MestQ07646 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MestQ07646 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MestQ07646 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MestQ07646 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MestQ07646 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MestQ07646 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MestQ07646 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MestQ07646 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MestQ07646 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MestQ07646 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MestQ07646 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms