Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf9Q07105 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms