Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APBA1Q02410 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms