Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE1BQ01064 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE1BQ01064 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1BQ01064 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms