Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Yy1Q00899 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Yy1Q00899 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yy1Q00899 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms