Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms