Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frat1P70339 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frat1P70339 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frat1P70339 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frat1P70339 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frat1P70339 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frat1P70339 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frat1P70339 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frat1P70339 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frat1P70339 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Frat1P70339 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frat1P70339 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frat1P70339 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frat1P70339 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms