Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox2P48432 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox2P48432 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox2P48432 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms