Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl6P47911 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl6P47911 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl6P47911 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl6P47911 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl6P47911 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl6P47911 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl6P47911 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl6P47911 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms