Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdkn1bP46414 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn1bP46414 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms