Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCG1P45844 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms