Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGM1P36871 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGM1P36871 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGM1P36871 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGM1P36871 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PGM1P36871 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PGM1P36871 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGM1P36871 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms