Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kif3aP28741 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif3aP28741 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms