Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf239P24399 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf239P24399 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms