Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms