Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cox4i1P19783 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox4i1P19783 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms