Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AppP12023 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AppP12023 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AppP12023 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AppP12023 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AppP12023 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AppP12023 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AppP12023 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AppP12023 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AppP12023 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AppP12023 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AppP12023 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AppP12023 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AppP12023 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AppP12023 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AppP12023 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AppP12023 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AppP12023 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AppP12023 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AppP12023 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AppP12023 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AppP12023 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AppP12023 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AppP12023 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AppP12023 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AppP12023 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AppP12023 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AppP12023 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AppP12023 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AppP12023 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AppP12023 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AppP12023 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AppP12023 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AppP12023 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AppP12023 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AppP12023 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AppP12023 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AppP12023 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AppP12023 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AppP12023 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AppP12023 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AppP12023 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AppP12023 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AppP12023 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AppP12023 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AppP12023 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AppP12023 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AppP12023 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AppP12023 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AppP12023 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AppP12023 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AppP12023 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AppP12023 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AppP12023 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AppP12023 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AppP12023 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AppP12023 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AppP12023 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AppP12023 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AppP12023 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AppP12023 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AppP12023 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AppP12023 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AppP12023 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AppP12023 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AppP12023 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AppP12023 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AppP12023 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AppP12023 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AppP12023 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AppP12023 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AppP12023 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AppP12023 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AppP12023 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AppP12023 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AppP12023 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AppP12023 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AppP12023 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AppP12023 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms