Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01678 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01678 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01678 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01678 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01678 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01678 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01678 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
P01678 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01678 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01678 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01678 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01678 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01678 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01678 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01678 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01678 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
P01678 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01678 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01678 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01678 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01678 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01678 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01678 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01678 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
P01678 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01678 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01678 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01678 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01678 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01678 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01678 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01678 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01678 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01678 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
P01678 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01678 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
P01678 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01678 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01678 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01678 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01678 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01678 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01678 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01678 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01678 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01678 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01678 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01678 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01678 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01678 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01678 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
P01678 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01678 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01678 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01678 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01678 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01678 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
P01678 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01678 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01678 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01678 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01678 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01678 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01678 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01678 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01678 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01678 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01678 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01678 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01678 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01678 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01678 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01678 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01678 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01678 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01678 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms