Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6AO75865 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6AO75865 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms