Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vamp4O70480 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vamp4O70480 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms