Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms