Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IfnabL7MTU6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IfnabL7MTU6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms