Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp994J3QM38 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp994J3QM38 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms