Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20828J3KMI7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20828J3KMI7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms