Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh18E9Q9Q6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdh18E9Q9Q6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms