Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20425E9Q035 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20425E9Q035 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm20425E9Q035 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm20425E9Q035 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm20425E9Q035 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms