Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AU019823E9PUQ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU019823E9PUQ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU019823E9PUQ3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms