Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprbB2RU80 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprbB2RU80 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms