Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubl3Q9Z2M6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms