Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB5Q9Y5E4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB5Q9Y5E4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms