Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXND1Q9Y4D7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXND1Q9Y4D7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXND1Q9Y4D7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms