Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hic1Q9R1Y5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hic1Q9R1Y5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hic1Q9R1Y5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.7 ms