Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx6Q9R1R0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lhx6Q9R1R0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhx6Q9R1R0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhx6Q9R1R0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhx6Q9R1R0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhx6Q9R1R0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhx6Q9R1R0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhx6Q9R1R0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhx6Q9R1R0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhx6Q9R1R0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhx6Q9R1R0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lhx6Q9R1R0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms