Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cry2Q9R194 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry2Q9R194 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cry2Q9R194 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms